Скидки от вида оплаты

Можно автоматически назначать статус пользователям, в зависимости от выбранного ими способа оплаты.

Для этого в меню Пользователи - Статусы создайте статус пользователя:

В меню Заказы - способы оплат укажите, какой статус пользователя должен применяться при выборе способа оплаты: